У анаеробни организми су потпуно у супротности са организме аеробик, они не користе Диатомиц кисеоник за раст, метаболизам и диференцијације, ове раду са различитим једињења, дајући ставите субцлассифицатион ако поменути микроорганизми раде са хемијског једињења под називом пируват каже његов Метаболизам је ферментацијски (користе ферментацију), с друге стране, то је друга супстанца која није пируват ако каже да је то организам који практикује анаеробно дисање.
Ферментација се састоји од добијања хемијске енергије из катаболичког процеса и недовршене или непотпуне оксидације органског једињења, према свом коначном производу може се класификовати у алкохолну ферментацију, јер производи етанол, млечна ферментација производи млечну киселину, маслачна ферментација, између осталог; Са своје стране, анаеробно дисање се састоји од транспортног ланца за електроне, обично сличног оном код аеробног дисања, али уместо крајњег акцептора је кисеоник, у овом случају то би било неко једињење неорганске природе.
Као што постоје аеробне бактерије, тако постоје и анаеробне бактерије које могу да живе без кисеоника, неке од њих се налазе у људском телу на местима где нема присуства кисеоника, на пример у дебелом цреву где делују као трулежне бактерије. фекалне материје, према отпорности на кисеоник, могу се класификовати као: обвезне анаеробне бактерије, оне не могу расти у областима у којима је присутан кисеоник, јер је штетна и може проузроковати њено уништавање, аеротолерантне бактерије никада неће користити кисеоник за своје метаболичке процесе али могу да живе у кисеоничном окружењу, факултативним анаеробимамогу да користе кисеоник као завршни акцептор електрона, али ако су у срединама у којима нема кисеоника, користе пут ферментације.