Археје су група једноћелијских микроорганизама који попут бактерија имају прокариотску морфологију, односно немају језгро или унутрашње опнене органеле, али се у основи разликују од њих, на начин да интегришу сопствену средину. Архејама није потребна сунчева светлост за процес фотосинтезе, као што је случај са биљкама, нити кисеоник.
Већина археја има ћелијски зид изграђен од протеина који чине круту групу која покрива спољни слој ћелије, стварајући заштитну мрежу која хемијски и физички утиче на ћелију.
Важно је напоменути да је анализа ових микроорганизама у почетку била везана за анализу бактерија, међутим почеле су да се примећују њихове јединствене карактеристике, које не морају нужно одговарати истим карактеристикама бактерија и других прокарионтских организама.
Овај израз је грчког порекла и значи „прастари“, јер то има древну молекуларну машинерију, која је сачувана без значајнијих промена у односу на било коју другу породицу микроорганизама.
Ови микроби углавном живе у екстремним срединама, због чега их и зову екстремофили. Иако постоје и други који преживе у уобичајеним нивоима сланости и температурама, а можда постоје и они који живе у цревима живих бића.
Термофилне археје су оне које живе у изузетно врућим срединама, док оне које насељавају супер слане средине називају хиперсалинским, оне имају способност да живе у екстремним срединама где други организми не могу да настањују.
Археје се слободно могу наћи у природи: у изворима, у земљишту итд.