Етимологија речи филогенија потиче од грчког „пхилон“ што значи племе или раса и „ген“ што значи да се производи или генерише, то је грана биологије која је одговорна за проучавање порекла и развоја врста на начин глобална. Термин је први пут употребио биолог Ернст Хаецкел 1866. године, овај део биологије је потврдио теорије које су предложили биолози Цхарлес Дарвин и Алфред Руссел Валлаце које су говориле да жива бића не остају непромењена већ еволуирају током времена. време.
Ова наука дели идеју да сва жива бића имају заједничког претка и као што је поменуто, она проучава односе који постоје између различитих организама и покушава да успостави потомство или сродство које може постојати између једног и другог. Тренутно, као резултат еволуције у области од генетике, сличности и разлике између једне врсте и други могу бити ефикасније студирао.
Током година делила се идеја да се жива бића развијају због мутација у ДНК, како би се што боље прилагодиле животној средини, у неким случајевима ове мутације уступају место новим врстама, али у другим тим Модификације ДНК мењају само неке особине које ће помоћи врсти да се прилагоди свом екосистему.
Примена филогеније данас је омогућила велики напредак у научном и медицинском пољу, пример за то је проучавање митохондријске секвенце, такође приликом откривања порекла заразне болести приликом поређења сојева бактерија и вируси.
