Хидрогеноми су најчудније еукариотске органеле са највећим растом на свету. Ова органела се налази у цитоплазми, састављена је од двоструког ткива, где унутрашња мембрана даје изглед гребена. Хидрогеноми су еволуирали из митохондрија цурењем елементарних митохондријских карактеристика, као што је губитак њиховог генома.
Величина ових органела је приближно један пречник. Његова главна функција је да интервенише у процесу ферментационог метаболизма неких бића изабраних за стицање АТП (молекула енергије) у околностима недостатка кисеоника. Треба напоменути да је ова функција слична дисању митохондрија које врше анаеробни микроорганизми. У њима се разграђују пирувичне киселине, који су неопходни молекули у метаболизму, налази се тачно у средишту путева за добијање енергије од сваког живог бића. Разградња пирувичне киселине је процес који спроводи хидроген који апсорбује ЦО2, ацетат који се избацује у ћелијску цитоплазму.
Сада би горе објашњени поступак могао да опише еволуцију митохондрија, међутим то се мора врло пажљиво открити, јер се не зна тачно да ли су митохондрији и хидрогеноми органеле које су заједно еволуирале. Конкретно, било би неопходно истражити да ли хидрогеноми имају ланце за пренос електрона. Ово је изузетно важно јер је транспорт водоника угрожен у процесу дисања. Ако обе органеле користе сличне протеине, може се закључити да су повезани и супротстављањем ових протеина сличним бактеријским, биће могуће заиста знати да ли су хидрогеноми изведени из митохондрија или, напротив, имају независно порекло
На крају, треба додати да је откриће ових органела направљено 70-их година.
