Реч микроорганизам потиче од грчког, формираног од „микро“ што значи мали, плус корен „органон“ што значи орган, алат или инструмент и суфикс „исм“ што значи активност или систем. Под микроорганизмом се подразумијевају сви они организми, облици живота или једноћелијска жива бића , углавном, мада су у неким случајевима то ценотични организми састављени од врло малих вишедјеличних ћелија или чак вишећелијских, који се могу подијелити само помоћу микроскоп; Наука која проучава ове микроскопске појаве је микробиологија. Ови микроорганизми укључују бактерије, вирусе, плесни и квасце.
Вреди напоменути ове микроорганизме, зване и микроби; Они могу проузроковати оштећење или погоршање многих намирница, а самим тим и узрочници болести када се конзумирају због њиховог загађења, то су патогени микроорганизми, који ако се на време не боре против њих заражена особа, животиња или биљка могу да болују од болести које могу генеришу компликације, стављајући тако свој живот у опасност или такође заразе људе који имају контакт са њима. Иако можда постоје неки патогени микроорганизми који не узрокују такво погоршање хране, па је стога важно додати да постоје неки микроорганизми који су обично корисни, све док се не користе у преради хране ради продужења њихове трајности или промене њихових својстава; чест случај је ферментација која се врши за производњу сира или јогурта. И на крају можемо рећи да микроби имају различите величине и облике.
