Микроорганизми се могу дефинисати као врста живих бића мале величине до те мере да су невидљиви за људско око. То могу бити различите врсте, међу најважнијима су алге, гљивице, бактерије итд. Постоје они који одржавају хипотезу да су неки микроорганизми били претеча живота на планети Земљи, док друге нешто сложеније претпоставке потврђују да су они ванземаљског порекла и да су се у то време проширили по лицу планете и дали живот свему што је данас. Генерално, врло је често да се микроорганизми састоје од ћелије јединствен, међутим то не значи да не постоје они који се састоје од више од једне ћелије.
Вођени потребом за суочавањем са болестима, проучавање микроорганизама имало је велики импулс, из тог разлога, јер се медицина развијала на исти начин као и знање о овим живим бићима.
Одређени микроорганизми се сматрају одговорним за штету одређених намирница, што може бити штетно за оне појединце који су конзумирали такву храну, узрокујући разне болести, упркос томе што постоје одређени микроорганизми који могу допринети различитим поступцима, пример за то је ферментација где се наведени организми користе за прављење хране као што су јогурт или сир, односно постоје микроорганизми који могу променити конфигурацију одређене хране или чак продужити њихов животни век.
Микроорганизми који имају највеће присуство у природи су бактерије које се могу наћи у различитим врстама станишта, постоје бактерије које могу бити штетне по здравље људи, пример за то је " Есцхерицхиа цоли ", која је одговорна за болести попут септикемије. Упркос томе, постоје и друге бактерије које могу бити корисне за тело, пример је „Лацтобациллус ацидопхилус“ који има способност да производи различите супстанце као што су витамин К и водоник-пероксид, што може бити од велике помоћи за организам.
