Реч молекул је умањеник од латинске речи „молес“ што значи маса, па молекул значи „мала маса“. Молекул је унија или скуп два или више атома, који могу бити исти или различити, уколико ови атоми се раздвоје да би променили својства материје.
Молекул је стабилан и електрично неутрална систем који се састоји од сета два или више атома везаних хемијским везама, које се зову ковалентне везе. Ови атоми могу бити исти као у случају водоника (Х2) и кисеоника (О2), који су дијатонски молекули, или их могу формирати различити атоми, као што је случај са водом (Х2О), која је састављена од два атома водоника. и један од гаса кисеоника и метана (ЦХ4) у чијем су молекулу четири атома водоника повезана са једним угљеником.
Молекул се сматра најмањи део који се може добити од материја тако да може задржати хемијске особине. Главни разлог за стварање молекула је тај што постоје атоми који теже да достигну минимални енергетски услов, а да би то постигли, то чини ковалентним везама са другим атомима који представљају исто стање, а та веза се не може лако растворити, и тада се рађа молекул.
У супстанци, молекули који их чине нису статични, напротив, они су у сталном кретању, што се назива молекуларна вибрација, а то заузврат може бити флексија или напетост.
